מכון אבולעפיה שם לו למטרה לפעול להכשרת דור חדש של מטפלים שידע לשלב בין שיטות עבודה מוכרות ובעלות תוקף מדעי מעולם הטיפול הרגשי, לבין תוכן יהודי עמוק הלקוח מאוצרות החוכמה היהודית. תכניות הלימודים שלנו עוסקות בהכשרת מטפלים רגשיים להתבוננות הוליסטית, כך שידעו לבסס את הרפואה המונעת כגורם מרכזי בתוך קשר טיפולי. המכון מקדם מענה משמעותי לחוסר הקיים כיום בחברה בתחום הסיוע הנפשי. כמו כן המכון פועל להגדלת זמינות הסיוע הנפשי עבור כל מי שזקוק לכך, בעלות שווה לכל נפש. מכון אבולעפיה מקדם תכנית לרפואה נפשית מונעת במערכת החינוך- מגיל הגן ועד לתיכון.